Ausreichende Daten zu einer Impfung während der Etanercept-Behandlung liegen derzeit nicht vor. Da Etanercept –wie die anderen TNF-Inhibitoren – die Immunabwehr beeinträchtigen und Immunreaktionen verändern kann, sind Lebendimpfstoffe (z.B. Masern-Mumps-Röteln, Gelbfieber) während einer Etanercept Therapie kontraindiziert. Ausnahmen können sich in sehr speziellen, individuell begründeten Einzelfällen und nach sehr strenger Indikationsstellung unter entsprechender sehr differenzierter Aufklärung des Patienten ergeben. Eine entsprechende Dokumentation wird unsererseits in einem solchen Fall dringend empfohlen. Totimpfstoffe können hingegen eingesetzt werden.
In einer doppelblinden, placebokontrollierten Studie bei Patienten mit Psoriasis-Arthritis, die in der vierten Behandlungswoche eine Pneumokokken-Impfung erhielten, waren die meisten Patienten unter Etanercept in der Lage, eine effektive Immunantwort auf den Impfstoff aufzubauen. Allerdings waren die Titer in der Summe etwas niedriger als bei den Patienten, die kein Etanercept erhalten hatten. Inwieweit die Impfung nicht den gewünschten Schutz geboten hat, ist nicht bekannt. Es wird empfohlen, geplante bzw. notwendige Impfungen vor Aufnahme einer Therapie mit TNF-alpha-Blockern durchzuführen.